草鱼肠道微生物组的功能特征
发布时间:2024-01-18
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题目名称:(英文)Deciphering the gut microbiome of grass carp through multi-omics approach
作者:Ming Li, Hui Liang, Hongwei Yang, Qianwen Ding, Rui Xia, Jie Chen, Wenhao Zhou, Yalin Yang, Zhen Zhang, Yuanyuan Yao, Chao Ran & Zhigang Zhou
刊物名称:Microbiome
发表年份:2024
摘要内容:
该研究利用宏基因组学技术,构建了草鱼肠道微生物的非冗余基因目录 (57.6万个基因),并对基因目录进行了系统的分类学和功能注释。通过肠道微生物的共现网络分析和与宿主肠肝功能基因表达的关联研究发现草鱼肠道微生物存在两个功能群,二者在生态学上表现为互斥模式, 并在与宿主互作方面存在显著差异。进一步发现,两个功能群在碳水化合物利用、毒力因子和抗生素耐药性基因方面均表现出显著的遗传能力差异。研究发现"功能群2/功能群1"的比值能够有效反映不同饮食下草鱼的肠道微生物群结构及功能特征,提示该比值可作为评估鱼类肠道菌群稳态的指标。研究结果丰富了鱼类肠道微生物的基因目录资源,揭示了鱼类肠道菌群主要门类的功能特征,并提出了肠道菌群调控的潜在靶标,有利于靶向或源于肠道微生物的水产养殖绿色投入品开发。

原文链接: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01715-7